『メン・イン・ブラック シーズン3』は、1999年秋に放送された全14話のSFコメディTVアニメシリーズである。本作は、シリーズ一貫の軽快なユーモアと宇宙人冒険が融合したスタイルを継承し、主にユニット形式の物語を好み、SFやアクション要素に興味を持つ若年層から大人の視聴者を対象としている。アニメーション表現においても、前2シーズンの鮮明なビジュアル特色と速いテンポのストーリー展開を維持している。