従来の童話を一新したアニメーション映画が、新たな可愛らしい姿で登場。はるか遠くに、幻想的で神秘的な「神秘島」という島がある。突然の休暇をきっかけに、お茶目な子豚のピーピー、可愛らしい子豚のナナ、そして間が抜けた犬のシューピーという3人の仲間が、神秘島への奇妙な旅に出る…愛嬌たっぷりの子豚たちはどんな危険な目に遭うのか？そして勇気と知恵を駆使して、次々と迫る危機をどう乗り越えるのか？冒険が今、始まる…