『菌軍征服』は1927年夏に公開された日本のアニメーション映画作品であり、初期アニメーション映画のジャンルに属する。本作は単話形式で構成され、全長約2巻。主にアニメーション映画史や初期の実験的作品に関心を持つ観客を対象としている。その作風は20世紀初頭のアニメーションの探求的特徴を体現し、鮮明な時代の刻印を有している。