6年前、9歳の天使恵はある偶然の機会に一人の巫士を助け、巫士から魔法の本を贈られた。本を開き、天使恵が本の中のピエロに「男の中の男になりたい」と願いをかけた後、ピエロはなんと彼を「女の中の女」に変えてしまった……。この過程を目撃し、真相を知っているのは恵と一緒にいた親友の花華院美木だけで、他の人々の記憶では恵が男の子だったことは消されてしまった。こうして恵は、男子たちをよだれたらせ、女子たちに嫉妬される絶世の美女という姿で、変身から10年間の学園生活を送ることになる……。ただし、「彼女」の性格は相変わらずケンカっ早く（腕前も）、男らしいまま。蘇我源造、中学で悪名高い生徒だが、恵と出会ってからは一度もケンカで勝てず、さらに自分を倒した恵に助けられる始末、まったく情けない……。一方、クラスでは藤木一郎、安田太助らが「天使恵親衛隊」を結成し、姫を守るためなら何でもする？ 要するに、「天使な小生意気」は笑い溢れる学園ストーリーアニメである。