『軍機令』は軍事謀略をテーマとしたTVアニメ作品であり、主に歴史戦争題材と戦略駆け引きに興味を持つ青少年及び成人視聴者を対象としている。作品は写実と劇的表現を融合した美術スタイルを採用し、戦場の情勢描写と知謀対決の表現に重点を置き、全体的な雰囲気は厳粛で緊張感に満ちている。