古代日本。片目の少年クボは、村で病の母を世話していた。過去の霊が長きにわたる因縁を再燃させ、クボの人生は一変する。神々や怪物がクボを追いかける中、大混乱が巻き起こる。生き延びるため、クボは亡き父である伝説のサムライ戦士がかつて求めた魔法の鎧を探し出さねばならない。途中、仲間となるモンキーとビートルも現れる。