日本で有名なカード対戦ゲーム『バトルスピリッツ』は、昨年9月7日に同名テレビアニメ『バトルスピリッツ 少年突破バシン』（別名：少年突破バシン）が放送されて以来、広く人気を集め、原作ゲームに多くの新規プレイヤーを呼び込んできた。『少年突破バシン』の物語が最終クライマックスに向かう中、7月16日に盛大な記者会見が開催され、今年9月から引き続き放送される最新シリーズ『バトルスピリッツ 少年激覇ダン』が発表された。 第二シーズンの物語では、主人公・馬神弾の夢はカードバトルゲーム「バトルスピリッツ」で優勝することだったが、ある日、対戦で知り合った奇妙な女性に追いかけられ、縁あって異界王が支配する時空に迷い込む。そこで彼と同じく異世界に来た「核の光主」と呼ばれる他の少年少女たちと出会い、六つの異なる世界を旅することになる。彼らは実体化可能な「バトルスピリッツ」を通じて、異界王の強大な配下たちと戦っていく。果たして誰が異界王を倒し、最強の称号を手にするのか？！