国際スパイ機関「ISIS」では、世界的危機さえも訓練された職員たちが互いに混乱させ、足を引っ張り、裏切り、徹底的に足蹴にする絶好の機間に過ぎない。その中心にいるのは、洗練された天才スパイ・スターリング・アーチャー。彼の男らしさに欠けるコードネームは「公爵夫人」。アーチャーは支配欲の強い母親マロリーと働いており、彼女は同時に彼の上司でもある。ドラマは、アーチャーの元恋人でエージェントのラナ・ケインと彼女の新しい恋人であるISIS会計係のシリル・フィギス、そしてマロリーの恋煩いする秘書チェリルを軸に展開する。