少女コララインは新居に引っ越した後、古びて活気のない環境に退屈を感じていた。つまらない堅物の両親、風変わりな隣人、それに嫌な少年と彼の黒猫。そんな生活は、奇想天外な彼女にとっては耐え難いものだった。しかし、状況はいつも最悪というわけではなかった。ある夜、彼女は家の13番目のドアの裏に秘密の通路を発見する。スリルと冒険を好むコララインは、もちろんその真相を探る機会を逃さず、その通路をゆっくりと這って進んでいく。コララインは、通路の先が現実と全く同じでありながらも異なる世界であることに気づく。すべてがここで複製されているようだが、彼女の夢はここで実現されていた。そしてコララインが最も喜んだのは、この世界の母親が自分に優しく、何でも言うことを聞いてくれることだった。しかしその後、彼女はこの「もうひとりのママ」が自分に目を縫い付け、永遠にこの「奇妙な」世界に留めようとしていることを知る。コララインは大変な危険に直面していることに気づき、「もうひとりのママ」の魔の手から逃れる方法を見つけなければならなかった。