物語は、一見ごく普通の少女アミが、誰にも言えない秘密を抱えていることから始まる。それは、彼女が自分の部屋で不思議な動物たちと一緒に暮らしているということだ。天真爛漫なイユ、ふざけるのが大好きなケンタ、疲れを知らないイサ。彼らは異次元から来た動物たちが暮らす街「アニマル横町」の住人で、なぜかアミの部屋に秘密の扉を作ってしまった。そして「アニマル横町」の謎めいたキャラクターたちも次々と登場していく。