テレビアニメシリーズが最終回となる第十三話の放送を控えた時期に、京都アニメーションは、元のシリーズのスタッフと声優陣に特別編「AIR IN SUMMER」の制作を依頼した。これは『山路～mountain path～』と『天地～universe～』の2話で構成されている。テレビアニメ版『AIR』では既に「Summer編」のストーリーが触れられていたが、実際にはゲームの内容に比べて大幅に省略されていた。そこでこの2話では、元のアニメ第八話から直接続き、第九話と第十話で描かれた「SUMMER編」のキャラクターストーリー部分を拡充している。内容は柳也を主な視点人物とし、神奈や里葉と共に八百比丘尼を探す旅の途中で起こった物語を描く。特別編アニメはより精緻な制作を経て、2005年8月28日と9月4日にBS-iで初めて放送された。