サトシとピカチュウは、とあるトレーナーとポケモンバトルをしていた。白熱したバトルの最中、突然大きな光に包まれ、見知らぬ場所へと吹き飛ばされてしまう。元の場所へ戻る手がかりであるセレビィを追いかけたサトシたちが見たものは…！？