爆丸インタースペースは、プレイヤー同士が対戦し、トーナメントに参加できる仮想現実システムだ。元々は爆丸の技を練習し、高めるための補助として設計されたが、すぐに多くの愛好家たちの出会いの場となった。空操弾馬のデュエルの最中、インタースペースはクラッシュし、彼は意識を失ってしまう。意識を取り戻す前に、彼は再び戦い合う爆丸たちの幻視を体験する。 弾馬の戦いに伴い、システムをシャットダウンさせたエネルギーの爆発は銀河を横断する衝撃波を送り、ガンダリアンの組織「十二騎士団」の注意を引く。彼らは爆丸インタースペースに潜入し、もう一つの異星種族ネイシアンとの迫り来る戦争に加わる強い闘士を探し求める。 弾馬と仲間たち——風見駿と丸蔵兆治——は、すぐに地球外戦争に巻き込まれることになる。しかし、どんなに遠い戦いのように思えても、その衝突は地球そのものの主権と、爆丸種族の未来をも脅かすのだ。 [Written by MAL Rewrite]