「鎧真伝サムライトルーパー」第二部。 新たな敵「暗黒の軍団」が現れ、世界は再び危機に陥る。鎧武将たちは、伝説の鎧「輝煌帝」の真の力を求めて、仲間と絆を深めながら戦いを続ける。しかし、敵の首領・アラゴの目的は、彼らが守るものそのものを歪めることにあった。真の強さとは何か、仲間を守る覚悟とは――。熱き戦いの新章、開幕。