Zweiの舞台はTVアニメ完結時から一年後。 　　エリカは既にマイスターとなったが、まだ「未熟」であり、マリア様の指導を受け続けなければならない。一方で、真白も学びを重ね、より女王らしくなってきた。 　　ある日、新設された天文台が隕石の落下を予測する。もし落下すれば、風花王国と近隣諸国は壊滅的な被害を受けることになり、マイスターたちは協力してこの隕石に立ち向かわなければならない！しかし、これは新たな物語の始まりに過ぎず、惑星エアル史上最大の危機が幕を開ける！